A Bandeira da escola foi criada no ano de 2003, pelos professores e alunos da escola. Nela aparece o símbolo da escola o qual possuí o seguinte significado:
O Violino representa o início da escola, o sol no centro, representa o brilho do saber, a força que o estudo nos oferece, dentro do sol o mapa do município de Porto União, em volta um laço de fita azul simbolizando a união das comunidades atendidas pela escola.
